Обычно симптомы начинаются через 7-14 дней после начала инфекции. Как правило, первый симптом - воспаление мочеиспускательного канала (уретры). У мужчин это воспаление сопровождается умеренной болью при мочеиспускании и появлением выделений из уретры. Иногда возникает
воспаление и болезненность предстательной железы. Симптомы со стороны половых органов и мочевыводящих путей у женщин, если они возникают, обычно легкие и ограничиваются скудными выделениями из влагалища или дискомфортом при мочеиспускании.
Конъюнктива (оболочка, выстилающая веко и покрывающая глазное яблоко) краснеет и воспаляется, появляются
зуд или жжение и слезотечение. Боль и воспаление в суставах могут быть как незначительными, так и выраженными. Обычно в процесс вовлекается одновременно несколько суставов - особенно коленные, суставы пальцев ног, а также места, где сухожилия присоединяются к костям, например бугор пяточной кости. В более тяжелых случаях воспаление поражает суставы позвоночника.
Во рту, на языке и на конце полового члена появляются маленькие безболезненные язвочки. Иногда на коже может развиваться характерная сыпь в виде твердых, плотных пятен, особенно на ладонях и подошвах. Кожа под ногтями иногда желтеет.
У большинства людей начальные симптомы исчезают через 3 или 4 месяца. В половине случаев, однако, артрит или другие симптомы в течение нескольких лет рецидивируют. Если симптомы сохраняются или часто рецидивируют, могут развиваться деформации суставов и позвоночника. Очень небольшое число людей, перенесших синдром Рейтера, становятся нетрудоспособными.