Распространенной причиной хронического гепатита является вирус гепатита C: в 75% случаев острый гепатит C переходит в хроническую форму. Реже хронический инфекционный процесс вызывает вирус гепатита B, иногда в сочетании с вирусом гепатита D. Вирусы гепатита А и E не вызывают хронического гепатита. Лекарства, например метилдопа, изониазид (тубазид), нитрофурантоин (фурадонин) и, возможно,
парацетамол, тоже могут спровоцировать хронический гепатит, особенно когда их принимают длительно. У детей и взрослых молодых людей хронический гепатит вызывает гепатолентикулярная дегенерация - наследственная болезнь, при которой происходит накопление в печени меди.
Неизвестно, почему одни и те же вирусы и лекарства вызывают хронический гепатит у одних людей, но не действуют таким же образом на других, и почему настолько разной бывает степень тяжести заболевания. Возможно, что хронический гепатит развивается у тех людей, чья иммунная система бурно реагирует на вирус или лекарство.
Во многих случаях причину заболевания хроническим гепатитом не удается установить. Вероятно, здесь играет роль избыточная реакция иммунной системы, приводящая к развитию хронического воспаления. Это состояние, называемое аутоиммунным гепатитом, чаще встречается у женщин.