При этой редкой разновидности злокачественных опухолей поджелудочной железы прогноз намного благоприятнее, чем при
аденокарциноме. К моменту операции только 20% от числа цистаденокарцином распространяются за пределы поджелудочной железы. Если опухоль не метастазирует и вся поджелудочная железа удалена во время операции, вероятность по крайней мере 5-летнего выживания - 65%.